Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms