Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms