Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms