Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms