Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms