Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms