Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms