Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDRT15Q96T59 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms