Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms