Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms