Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms