Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRAT1Q92837 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms