Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms