Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.9 ms