Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms