Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms