Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERC6Q8IVU3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms