Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC16A9Q7RTY1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC16A9Q7RTY1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC16A9Q7RTY1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC16A9Q7RTY1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC16A9Q7RTY1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC16A9Q7RTY1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC16A9Q7RTY1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC16A9Q7RTY1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC16A9Q7RTY1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms