Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM47EQ6ZV65 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM47EQ6ZV65 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms