Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms