Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms