Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RTL8BQ17RB0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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