Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CTF1Q16619 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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CTF1Q16619 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CTF1Q16619 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CTF1Q16619 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTF1Q16619 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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