Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRY1Q16526 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CRY1Q16526 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CRY1Q16526 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CRY1Q16526 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CRY1Q16526 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CRY1Q16526 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CRY1Q16526 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRY1Q16526 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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