Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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