Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CUL4AQ13619 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
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CUL4AQ13619 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CUL4AQ13619 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CUL4AQ13619 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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CUL4AQ13619 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CUL4AQ13619 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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