Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX6Q13608 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms