Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF5Q13568 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms