Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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