Protein–RNA interactions for Protein: Q13433

SLC39A6, Zinc transporter ZIP6, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A6Q13433 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A6Q13433 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms