Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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