Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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STRN3Q13033 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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STRN3Q13033 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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STRN3Q13033 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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