Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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