Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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