Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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