Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF3C1Q12789 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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GTF3C1Q12789 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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