Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms