Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms