Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EP300Q09472 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EP300Q09472 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EP300Q09472 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EP300Q09472 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EP300Q09472 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EP300Q09472 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms