Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms