Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms