Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms