Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms