Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms