Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms