Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms