Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms