Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX6-1P78426 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX6-1P78426 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX6-1P78426 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms