Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTG2P63267 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms