Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms